
Aperture Science - организация, научная лаборатория, в своё время являющаяся конкурентом Чёрной Мезы. Штаб-квартира Aperture Science находилась в Лаборатории исследования природы порталов.
Большая часть комплекса расположена под землёй. На момент игры находится под контролем ГЛэДОС — суперкомпьютера, который после своего запуска обрёл самосознание и уничтожил весь рабочий персонал лаборатории.
Именно принятые решения в стремлении обогнать Чёрную Мезу привели к выходу компьютера GLaDOS из-под контроля, а также к исчезновению Борея. Тем не менее, в какой-то момент Aperture Science удалось достигнуть значительных успехов и превзойти Мезу, о чём свидетельствуют графики, которые видны в конференц-зале лаборатории. Испытуемые приходят в себя в камере отдыха, где имеется герметичная капсула сна и туалет. Камера отдыха изолирована, из неё нет выхода, и выйти оттуда можно лишь через созданный портал. Работник, озадаченный постройкой Центра: «Посмотри-ка на запись камеры. Чем бы этот „подвал отдыха" не являлся, дверей у него нет».

Центр развития — главная и основная часть Лаборатории исследования природы порталов. Был создан для проведения испытаний с переносным устройством создания порталов. Участники в игровой форме проходили тестовые камеры, преодолевая различные препятствия и головоломки. За ними наблюдали учёные и делали выводы в пользе практического применения этой технологии.
Центр был почти полностью автономен, за пределами тестовых камер, находится множество обслуживающих различных механизмов. В Portal 2 можно будет увидеть ещё более сложную систему, которая сможет изменять даже саму структуру помещений.
Тестовые камеры имеют вид как различные комнаты, оформленные белыми панелями с различными объектами для проведения испытаний. В каждую камеру выходит окно с замутнённым стеклом, за ним находится небольшая комната, через которую учёные и наблюдали за происходящим. GLaDOS использует для наблюдения стационарные видеокамеры. Для перемещения в следующую комнату испытания используется специальный лифт.